Aquatic Biotechnology Lab
Our lab studies the fundamental question of how the development of complex organisms is controlled, using turbot and zebrafish as our models.
The main scientific objective of the Aquatic Biotchenology Lab is to apply molecular and cellular approaches to studies of early development and disease in fish, as well as to apply basic science to improve the yield, performance and sustainability of marine aquaculture at the global level.
Our lab's research generally focuses on understanding how the information encoded in DNA is accurately used by cells to perform the physiological functions required during the different developmental phases.
The disruption or breakdown of these regulatory mechanisms is responsible for many developmental abnormalities, such as morphological deformities. We aim to reveal the way some of these mechanisms work, which, in turn, will help us understand the cause of the associated abnormalities. We use zebrafish (Danio rerio) and turbot (Scophthalmus maximus) as model systems.
- Jesús Marco de Lucas; M. Victoria Moreno-Arribas; Montoliu, Lluís; Rada-Iglesias, Alvaro; Domínguez, María; Huertas Sánchez, Pablo; De Las Rivas, Javier; Rojas, A. M.; Azorín, Ferran; Rotllant, Josep; Gutiérrez Armenta, Crisanto; Hernández-Munaín, Cristina; Barco, Ángel; Gómez, María; Herrero, Antonia; Ramos, Lourdes; Fraga, Mario F.; Ramos, Sonia (2021) White Paper 3: Genome&Epigenetics Consejo Superior de Investigaciones Científicas ISBN:978-84-00-10739-0
- Guerrero-Peña, L.; Suarez-Bregua, P.; Méndez-Martínez, L.; García-Fernández, P.; Tur, R.; Rubiolo, J.A.; Tena, J.J.; Rotllant, J. (2021) Brains in Metamorphosis: Temporal Transcriptome Dynamics in Hatchery-Reared Flatfishes Biology DOI:10.3390/biology10121256
- Azorín F; Rotllant J; Albert Jordán; Ignacio Maeso; Miguel Manzanares; Álvaro Rad; Joaquim Roca; Guillermo Vicent (2021) 3D Genoma Architecture " Genome & epigenetics vol. 3" Consejo Superior de Investigaciones Científicas
- Henriques, D.; Balsa-Canto, E. (2021) The Monod Model Is Insufficient To Explain Biomass Growth in Nitrogen-Limited Yeast Fermentation Applied and Environmental Microbiology DOI:10.1128/AEM.01084-21
- Suarez-Bregua, P.; Pirraco, R.P.; Hernández-Urcera, J.; Reis, R.L.; Rotllant, J. (2021) Impact of dietary phosphorus on turbot bone mineral density and content Aquaculture Nutrition DOI:10.1111/anu.13253
- TFM - Andrielle Larissa Reascos Tatés (26/09/2022) Nuevas herramientas para la monitorización de cetáceos en el norte y noroeste de la Península Ibérica: ADN ambiental y drones UNIVERSIDAD COMPLUTENSE DE MADRID
- TFM - PRIYANKA SONI (15/07/2021) How Fishes Color their Skin: Genetic Analysis of Melanocortin Receptor 2 (MC2R) in Fish Pigmentation UNIVERSIDAD DEL PAIS VASCO (UPV/EHU )
- TFM - Lara Vidal Nogueira (04/09/2020) La arquitectura tridimensional del Genoma. Principios y funciones Univerdidad de Vigo (UVigo)
- TFM - Luis Méndez Martínez (14/07/2020) Caracterización funcional del papel del receptor de melanocortinas Mc2r en la formación del patrón de pigmentación en el pez cebra (Danio rerio) Univerdidad de Vigo (UVigo)
- TFM - Miguel Álvarez González (09/07/2020) Análisis de ADN ambiental (eDNA) y su aplicación para la monitorización de cetáceos en el Atlántico norte Universidade de Vigo (UVIGO)
- Capacidades | Avaliación da biodiversidadeInstrumental e sensores mariños Protección costeira e medioambiental Ordenación do espazo marítimo Servizos ecosistémicos e gobernación de ecosistemas
Facer seguimento da distribución temporal e espacial das especies, a abundancia e a biomasa de diversos taxons mediante diversas técnicas como e-ADN, caracterización de pigmentos, citometría de fluxo, telemetría acústica, toma de imaxes mediante sistemas de observación remota (p. ex., drons, etc.) ou identificación taxonómica clásica.
- Capacidades | Ómica avanzada aplicada a organismos marinos
Estudios sobre la estructura del genoma de organismos marinos, incluido el mapeo genético, la secuenciación de ADN, cómo se produce el conjunto completo de tránscritos de ARN por el genoma y cómo se ve afectado por el desarrollo, las enfermedades o los factores ambientales que determinan el fenotipo, especialmente la proteómica y la metabolómica, utilizando siempre las técnicas más avanzadas (ATAC-seq, MethylCap-Seq, RNA-seq, tecnología de ADN recombinante, CRISPR/Cas9 knockin y knockout , enhancer detector (ZED),tecnologías transgénicas Tol2 kit y BAC, etc.).
- Capabilities | Development and optimization of aquaculture systems for traditional and new farmed species
Development of integrated culture techniques for new aquaculture species, as well as optimization of traditional ones based on different approaches (i.e. early development, handling, feeding, disease and immune responses, ecophysiological performance, or ecosystem carrying capacity) to improve animal welfare, yield and sustainability in global marine aquaculture.
- Capacidades | Ómica avanzada aplicada a organismos mariños
Estudos sobre a estrutura do xenoma de organismos mariños, incluído o mapeado xenético, a secuenciación de ADN, como se produce o conxunto completo de transcritos de ARN polo xenoma e como se ve afectado polo desenvolvemento, as doenzas ou os factores ambientais que determinan o fenotipo, especialmente a proteómica e a metabolómica, utilizando sempre as técnicas máis avanzadas (ATAC-seq, MethylCap-Seq, RNA-seq, tecnoloxía de ADN recombinante, CRISPR/Cas9 knockin e knockout , enhancer detector (ZED),tecnoloxías transxénicas Tol2 kit e BAC, etc.).
- Capacidades | Desarrollo y optimización de sistemas de acuicultura para especies de cultivo tradicionales y nuevas
Desarrollo de técnicas de cultivo integradas para nuevas especies acuícolas, así como optimización de las especies tradicionales basada en diferentes enfoques (es decir, desarrollo temprano, manipulación, alimentación, enfermedades y respuesta inmunitaria, rendimiento ecofisiológico o capacidad de carga de los ecosistemas) para mejorar el bienestar animal, el rendimiento y la eficacia de la acuicultura marina a nivel global.
