JAE Intro 2024 | Até o 20/05 | Para grao e máster

Grupo:  Ecofisioloxía, Biomarcadores e Xestión Sostible de Bivalvos

Área: Vida  Referencia da oferta: JAEINT24_EX_0701

Contacto: José Babarro

A ostra rizada Magallana gigas, é unha especie importante para a acuicultura que foi introducida con fins comerciais nun gran número de países de todo o mundo. Cando se naturaliza, M. gigas pode alcanzar altas densidades e formar arrecifes extensos. Isto pode transformar completamente os hábitats nativos e ter profundos impactos nas comunidades residentes, polo que os beneficios da colleita comercial desta especie poden verse compensados polo seu impacto nas poboacións nativas.

En España, a maior parte da produción acuícola de M. gigas procede de Galicia (NO de España), onde a preocupación pola súa interacción con outras actividades marisqueiras está crecendo progresivamente debido á expansión desta especie. Ademais, dáse unha situación peculiar en canto á capacidade de establecemento desta especie entre as Rías Setentrionais (Rías Altas) e as Rías Sur (Rías Baixas). Mentres que as poboacións naturalizadas atópanse nas rías do norte, onde non se realiza a acuicultura, as do sur, que concentran o sector da acuicultura da ostra rizada dende os anos 90, só recentemente comezaron a rexistrar asentamentos naturais de M. gigas . Estes escenarios contrastados representan unha oportunidade moi interesante para comprender as vías de propagación e as barreiras para esta especie potencialmente invasora.

Dentro do proxecto OYSTER-WATCH, no noso grupo de investigación estanse a desenvolver sistemas para un seguimento rápido e preciso da distribución da ostra rizada a gran escala espacial mediante algoritmos AUV e IA. Deste xeito, preténdese desenvolver metodoloxías para controlar a expansión da especie, que permitan o desenvolvemento de ferramentas de control eficaces.

A proposta formativa que se ofrece para o JAE-INTRO estaría asociada aos resultados do devandito proxecto, xa que se propón validar estas novas técnicas de seguimento con metodoloxías clásicas de dinámica poboacional (transectos para estimar a densidade de adultos e o recrutamento de novos individuos). Este programa formativo permitirá coñecer os pros e os contras das diferentes técnicas para cuantificar a dinámica poboacional de especies bentónicas con especial atención ao papel das especies invasoras.

Requisitos: As persoas solicitantes deben estar a cursar un título de Grao ou Máster e cumprir con todos os requirimentos contemplados na convocatoria.

Grupo:  Inmunoloxía e Xenómica

Área: Vida  Referencia da oferta: JAEINT24_EX_1687

Contacto: Antonio Figueras

Estímase que para 2060 produciranse 1.000 millóns de toneladas de plástico ao ano. Actualmente hai 600 millóns de toneladas. Cada ano unhas 500.000 toneladas acaban no mar.

Os nanoplásticos son pequenas partículas de plástico de menos de 1000 nanómetros. Poden resultar da descomposición de obxectos plásticos máis grandes. Ademais, algúns produtos de consumo, como cosméticos e téxtiles, conteñen nanoplásticos . O seu pequeno tamaño fai que sexan facilmente inseribles e interiorizados polas células, causando diversos danos na maquinaria celular.

O mexillón ( Mytilus edulis , M. galloprovincialis ) é un molusco bivalvo filtrante que se atopa en todo o mundo. Desempeña un papel crucial nos ecosistemas mariños ao filtrar grandes volumes de auga para as partículas de alimentos. É por iso que os mexillóns poden acumular contaminantes e partículas presentes na auga, incluíndo microplásticos e nanoplásticos .

A persoa seleccionada aprenderá e utilizará técnicas para determinar o dano celular, a inflamación, a bioacumulación, a expresión xénica inducida pola exposición a nanoplásticos , o impacto na resposta a patóxenos.

Ademais, determinará a capacidade de concentración plástica do mexillón para comprender o proceso de bioamplificación e o posible risco para niveis tróficos superiores, incluídos os humanos. Utilizaremos o peixe cebra, modelo de enfermidades humanas, para avaliar este aspecto.

Requisitos: As persoas solicitantes deben estar a cursar un título de Grao ou Máster e cumprir con todos os requirimentos contemplados na convocatoria.

Grupo: Patobioloxía Molecular Mariña

Área: Vida  Referencia da oferta: JAEINT24_EX_1163

Contacto: Camino Gestal Mateo

O crecemento da especie ten importancia a aquacultura. base tanto en consideracións éticas como na necesidade de mellorar a calidade dos produtos da acuicultura. O polbo común, o polbo vulgaris , é unha especie comercialmente importante cun alto potencial de diversificación acuícola. Para protexer este importante recurso pesqueiro en Galicia, actualmente sobreexplotado, potenciar a bioeconomía mediante un uso máis eficiente dos recursos vivos e abastecer a forte demanda do mercado, é necesario desenvolver unha acuicultura eficiente e sostible que garanta o benestar animal. O polbo común é tamén un modelo na experimentación animal, o que require o seu mantemento en instalacións de acuarios en boas condicións de benestar e saúde. As condicións de catividade e o estrés ao que en ocasións poden estar sometidos os animais favorecen o desenvolvemento de enfermidades que deben ser controladas. Por iso, unha das prioridades como estratexia para mellorar a súa saúde e benestar en acuarios e/ ou instalacións de cultivo é a prevención de enfermidades e o aumento da súa capacidade de loita contra os patóxenos e as agresións externas.

O obxectivo principal desta proposta é polo tanto o desenvolvemento de metodoloxías non invasivas para a identificación rápida e sinxela dos principais patóxenos que poden afectar a esta especie co fin de deseñar un plan de vixilancia e vixilancia para o seu uso como indicador biolóxico do benestar. (OWI) en plantas de cultivo de polbo, que favorece o diagnóstico precoz e o control sanitario, mellorando a súa saúde e evitando enfermidades. Para iso utilizaranse mostras de pel e moco branquial, así como feces e filtrados de auga procedentes do tanque de mantemento ou cultivo. Desenvolveranse metodoloxías de Q-PCR absolutas específicas para cada un dos principais patóxenos identificados (protozoos, bacterias patóxenas e virus), metodoloxías que serán validadas e estandarizadas a partir das técnicas clásicas de diagnóstico. Tamén se utilizarán mostras de hemolinfa extraídas cunha simple punción para validar os parámetros da resposta inmune. Analizarase a expresión dos xenes de resposta inmune, seleccionados a partir de resultados transcriptómicos anteriores , para a súa validación como indicadores de benestar e saúde.

Os resultados obtidos pretenden ser unha ferramenta fundamental para o incipiente desenvolvemento da acuicultura de polbo común sostible.

Requisitos: As persoas solicitantes deben estar a cursar un título de Grao ou Máster e cumprir con todos os requirimentos contemplados na convocatoria.

Grupo: Procesos Oceánicos en Cambio Global

Área: Vida  Referencia da oferta: JAEINT24_EX_1663

Contacto: Miguel Gil Coto

No marco do proxecto de investigación STRAUSS (Effects of Ocean Waves in the Rías Baixas Upwelling System: surface dynamics on selected biological case studies) o IIM-CSIC desenvolveu dous dispositivos para medir o movemento de alta frecuencia de boias e bateas de mexillón. Ambos dispositivos electrónicos usan Unidades de Medición Inercial (IMU) implementadas nunha plataforma Arduino con capacidades de rexistro e transmisión de datos (GPRS).

Esperamos mellorar os algoritmos e os pasos de procesamento de datos necesarios para transformar os sinais da IMU nos parámetros das ondas oceánicas e os movementos das bateas de mexillón (que, en última instancia, producen desprazamentos de mexillón) coa boia e os dispositivos de balsa de mexillón, respectivamente.

Pretendemos coñecer os réximes de ondas nas Rías Baixas e o seu efecto na dinámica actual e o seu impacto no ecosistema.

Requisitos: As persoas solicitantes deben estar a cursar un título de Grao ou Máster e cumprir con todos os requirimentos contemplados na convocatoria.

Grupo: Procesos Oceánicos en Cambio Global

Área: Vida  Referencia da oferta: JAEINT24_EX_1558

Contacto: Carmen González Castro

As zonas costeiras son fronteira entre os sistemas terrestre, oceánico e atmosférico, polo que producen un intenso gradiente de ambos os sistemas. enerxía e materia. Unha das singularidades das zonas costeiras é a súa proximidade ao sedimento, que favorece os procesos de interacción con este límite e xoga un papel fundamental no ciclo do carbono a escala global.

Polo tanto, para comprender o funcionamento destes ecosistemas costeiros, é fundamental coñecer o seu metabolismo bentónico, é dicir, o equilibrio entre a produción primaria e a respiración total nesta capa límite bentónica. Os métodos máis utilizados para cuantificar o metabolismo do fondo mariño in situ foron as medicións de cámaras bentónicas e os microperfís , aplicados principalmente a sedimentos cohesivos.

Con todo, na última década o método eddy a covarianza foi moi utilizada debido á súa maior resolución espacial e temporal ( Berg et al., 2003). Non é unha técnica invasiva e pódese utilizar tanto en ambientes con sedimentos cohesivos como con sedimentos permeables. A técnica obtén fluxos bentónicos de O2 a partir de rexistros simultáneos de velocidade vertical e concentración de osíxeno nun determinado volume de auga.

Isto require medicións de alta frecuencia (>32 Hz), utilizando un ADV ( velocímetro acústico Doppler ) para as velocidades e un optodo de alta frecuencia para as concentracións de O2. Deste xeito, o caudal pódese obter por movemento turbulento e polo tanto o transporte neto de O2 ao sedimento.

O obxectivo principal desta proposta é cuantificar o metabolismo bentónico neto a partir das medicións do fluxo de osíxeno aplicando a técnica do remolino . covarianza . Para iso proponse que o candidato reanaliza os datos de ancoraxe do sistema de optodos ADV-O2 obtidos en diferentes mostraxes nas Rías Baixas e, se o tempo o permite, participe e analice os datos dun ancoraxe do sistema ADV-O2.

Como resultado do proxecto, espérase que o candidato adquira os coñecementos necesarios para desenvolver o seu traballo fin de máster. O plan de traballo consta de (1) Coñecemento do período inicial e tratamento de datos para o cálculo de fluxos bentónicos. (2) Realización de ancoraxe adicional en obra (3) Redacción do informe.

Requisitos: As persoas solicitantes deben estar a cursar un título de Grao ou Máster e cumprir con todos os requirimentos contemplados na convocatoria.

Grupo: Bioquímica de Alimentos

Supervisores: Ricardo I. Pérez Martin, Maria Blanco & Carmen Glez Sotelo

Área: Vida  Referencia da oferta: JAEINT24_EX_1598

Contacto: Carmen González Sotelo

O proxecto pretende que o alumno adquira coñecementos sobre o desenvolvemento e axuste de procesos. para a recuperación de descartes e subprodutos da pesca mediante metodoloxías de baixo impacto ambiental a partir de subprodutos pesqueiros, concretamente o traballo céntrase na obtención de coláxeno e forma parte dun proxecto de colaboración internacional WASTE2TASTE (“ Programa Sustainable Blue” Economy ). Asociación (SBEP).

O programa formativo inclúe catro obxectivos: 1. Coñecer as características dos subprodutos mediante a análise das características dos subprodutos ricos en coláxeno que se producen tanto a nivel industrial como polo comercio polo miúdo. Con este obxectivo, o candidato familiarizarase cos contornos industriais e obterá unha idea global da problemática da xeración e xestión deste tipo de residuos. Ademais, coñecerase no laboratorio as principais técnicas analíticas utilizadas para a súa caracterización fisicoquímica. 2. Coñecer os procesos, tanto tradicionais como de baixo impacto ambiental (extracción supercrítica, microondas ou ultrasóns) que se deseñarán no proxecto para obter coláxeno a partir dos subprodutos seleccionados. 3. Métodos de aprendizaxe para avaliar os procesos empregados na extracción de coláxeno, como análise de rendementos, tempos de extracción e características fisicoquímicas do coláxeno obtido: determinación da masa e estrutura molecular mediante cromatografía de permeación en xel (GPC) e intercambio iónico (SAX-HPLC). , electroforese SDS-PAGE, microscopía, espectroscopia FTIR e difracción de raios X (XRD); determinación de aminoácidos por HPLC. 4. Aprender a obter información científica, analizar datos, redactar informes e participar en reunións científicas.

Requisitos: As persoas solicitantes deben estar a cursar un título de Grao ou Máster e cumprir con todos os requirimentos contemplados na convocatoria.

Grupo: Ecoloxía e Recursos Mariños

Área: Vida  Referencia da oferta: JAEINT24_EX_ 0476

Contacto: Jorge Hernández Urcera

O plan de formación céntrase no estudo da ecoloxía e o comportamento dos cefalópodos no seu hábitat natural. O alumno/a terá a oportunidade de abordar diferentes aspectos da ecoloxía dos cefalópodos, unha clase de animais cunha capacidade excepcional para desenvolver unha ampla gama de comportamentos.

A súa impresionante capacidade neuronal modula estratexicamente o cerebro, os brazos e a pel, configurando un comportamento sincronizado que permite que estes invertebrados atopen a mellor forma de sobrevivir e perpetuar a especie. Moitos destes comportamentos, que xogan un papel fundamental na ecoloxía destas especies, xa foron descritos grazas principalmente a experimentos realizados en catividade, pero moitos outros están á espera de ser descubertos pola ciencia.

Recentemente, a ciencia cidadá adquiriu un papel fundamental para abordar cuestións de investigación inalcanzables mediante proxectos científicos convencionais. Aproveitando esta nova ventá de investigación, potenciamos e aumentamos exponencialmente a nosa capacidade para obter material audiovisual co que explorar os comportamentos dos cefalópodos que permanecen ocultos no medio mariño.

Na actualidade contamos coa colaboración de varios científicos cidadáns, principalmente mergulladores recreativos e fotógrafos submarinos, que nos están a achegar material de alto valor científico para explicar comportamentos interesantes de chocos, polbos e luras. A través do curado e tratamento destes datos, o alumno abordará diferentes aspectos da ecoloxía e o comportamento destas especies, como a cópula, a depredación, a alimentación, as relacións interespecíficas, etc.

Así mesmo, a persoa candidata poderá participar en saídas de campo dedicadas ao estudo dos cefalópodos no seu medio natural. O obxectivo do plan de adestramento é a análise de toda esta información para situala nun contexto ecolóxico, podendo así definir as estratexias que empregan estes animais para sobrevivir nun medio tan hostil.

O proxecto formativo constará de tres etapas: a) visualización e curado do banco de imaxes de cefalópodos e b) análise da información relevante rexistrada e c) definición de novos comportamentos das especies estudadas. Os resultados do proxecto formativo poderían dar lugar a publicacións científicas, que repercutirían notablemente na formación científica do/a candidato/a.

Requisitos: As persoas solicitantes deben estar a cursar un título de Grao ou Máster e cumprir con todos os requirimentos contemplados na convocatoria.

Grupo: Procesos Oceánicos en Cambio Global

Área: Vida  Referencia da oferta: JAEINT24_EX_1214

Contacto: María López Acosta

As esponxas xogan un papel fundamental nos ecosistemas mariños, contribuíndo á conservación da biodiversidade e á saúde dos océanos. Estes organismos son claves na reciclaxe de nutrientes como o silicio, conectando os procesos ecolóxicos e bioxeoquímicos que teñen lugar no fondo mariño cos que se producen na columna de auga.

As esponxas son consideradas potenciais "gañadoras" ante o cambio climático, pola súa aparente resistencia comparativa a condicións como o quecemento e a acidificación. Non obstante, os mecanismos que lles permiten tolerar estas novas condicións seguen sendo en gran parte descoñecidos. No marco do proxecto SPICA (SPonge Interacción no​ bioxeoquímica ciclo de silicona na era de​ Clima cambio), mediremos os efectos dos estresores do cambio climático na ecofisioloxía e a bioxeoquímica do silicio en esponxas. Paralelamente ás medicións de alta frecuencia dos estresores climáticos nas rías galegas e á estimación da biomasa e distribución destes organismos neste ecosistema, realizaremos unha primeira estimación do efecto do cambio climático na supervivencia das esponxas e a súa participación. en reciclaxe de silicio.

A persoa seleccionada terá a oportunidade de adquirir competencias en diversas disciplinas, entre elas a bioxeoquímica, a fisioloxía animal e a ecoloxía mariña. En particular, a persoa seleccionada adquirirá competencias no manexo de equipos de toma de mostras e medida de pH, nutrientes, entre outros, en augas mariñas.

Así mesmo, adquirirás habilidades en métodos analíticos para determinar cambios fisicoquímicos nos esqueletos silíceos de esponxas, participarás en incubación e experimentación con esponxas en acuarios, e aprenderás ferramentas para o seguimento de comunidades bentónicas, como a fotogrametría.

A persoa seleccionada tamén desenvolverá habilidades na análise e interpretación de datos, participando na xeración de resultados inéditos que serán compartidos coa comunidade científica a través da publicación en revistas especializadas e congresos.

Requisitos: As persoas solicitantes deben estar a cursar un título de Grao ou Máster e cumprir con todos os requirimentos contemplados na convocatoria.

Grupo: Procesos Oceánicos en Cambio Global

Área: Vida  Referencia da oferta: JAEINT24_EX_ 0583

Contacto: Marcos Fontela

Segundo o último informe do IPCC, co fin de limitar o quecemento global por debaixo dos 2 °C para 2100, o carbono será necesaria a eliminación de dióxido (CDR) da atmosfera. A mellora da alcalinidade do océano (OAE) é unha técnica CDR mariña prometedora baseada no proceso natural de meteorización que ten o maior potencial global entre todas as outras tecnoloxías CDR mariñas propostas ata a data.

Esta adición de alcalinidade é capaz de neutralizar máis CO₂ presente na auga e máis CO₂ que se absorbe da atmosfera. Ademais, engadir alcalinidade non só permite que o océano almacene máis carbono antropoxénico senón que tamén mellora a acidificación do océano, aumentando o pH da auga do mar e o estado de saturación de carbonato de calcio.

Polo tanto, xunto coa urxencia de mitigar o cambio climático, é necesario comprender a eficiencia potencial, a seguridade ambiental e a viabilidade do seguimento da OAE como técnica. Aquí propoñemos un enfoque interdisciplinar integrado.

Esta investigación levará a cabo experimentos de microcosmos da OAE con comunidades de plancto in situ para abordar os obxectivos da investigación. Brevemente, o mesmo tratamento de adición de alcalinidade aplicarase a dous escenarios diferentes: desequilibrado e equilibrado. O escenario desequilibrado simulará o feito de que a entrada de CO2 aínda non se produciu xusto despois da adición de alcalinidade, e o escenario equilibrado onde a auga de mar mellorada con alcalinidade xa se equilibrou co CO2 coa atmosfera. A adición de alcalinidade será a mesma: +500 µmolkg-1.

Ademais, haberá un microcosmos de control sen ningunha adición de alcalinidade. Un total de 9 microcosmos (3 réplicas por escenario) serán seguidos diariamente durante tres semanas. As medicións de parámetros bioxeoquímicos e mostras de alcalinidade total, pH, salinidade, luz, temperatura, nutrientes inorgánicos, clorofila a, carbono orgánico en partículas, sílice bioxénica, citometría de fluxo, microscopía e mostras de ADN serán recuperadas de forma programada. Prestarase especial atención a establecer metodoloxías estándar e rentables que garantan a reproducibilidade e a intercomparación .

A persoa candidadta formarase na configuración de microcosmos, procesamento multidisciplinar de mostras e análise da química do carbono inorgánico.

Requisitos: As persoas solicitantes deben estar a cursar un título de Grao ou Máster e cumprir con todos os requirimentos contemplados na convocatoria.

Grupo:  Inmunoloxía e Xenómica

Área: Vida  Referencia da oferta: JAEINT24_EX_1659

Contacto: Beatriz Novoa García

O obxectivo deste proxecto EoI é estudar as bases moleculares da resposta antiviral utilizando como modelo o peixe cebra (Danio rerio). Pretendemos comprender como aspectos intrínsecos do corpo como a inflamación ou o microbioma poden afectar á resistencia ás enfermidades virais.

A persoa candidata utilizará ferramentas de bioloxía celular e inmunoloxía e tamén ferramentas transcriptómicas (ARN seq ) e diversas ferramentas bioinformáticas para analizar a modulación da resposta inflamatoria e antiviral de macrófagos e neutrófilos fronte ás infeccións.

Estudarase o papel de diferentes xenes na resposta inmune innata, principalmente aqueles con relevancia en enfermidades inflamatorias humanas, bloqueando ou aumentando temporalmente a súa expresión.

Requisitos: As persoas solicitantes deben estar a cursar un título de Grao ou Máster e cumprir con todos os requirimentos contemplados na convocatoria.

Grupo: Inmunoloxía e Xenómica 

Área: Vida  Referencia da oferta: JAEINT24_EX_1664

Contacto: Patricia Pereiro González

Este plan de traballo pretende estudar as bases moleculares da posible implicación do metabolismo, e polo tanto de diferentes metabolitos, en a resposta inmune de peixes de interese comercial, como o rodaballo (Scophthalmus maximus) e a robaliza (Dicentrarchus labrax), contra diferentes patóxenos.

A inmunometabolómica é unha área de investigación emerxente que estuda a interacción do metabolismo e a inmunidade, dúas disciplinas consideradas independentes ata hai relativamente pouco tempo. De feito, o termo inmunometabolismo foi acuñado en 2011 por dous investigadores da Universidade de Harvard e desde entón este novo enfoque experimentou numerosos avances.

Actualmente sábese que ambos sistemas interactúan, tanto a nivel celular como sistémico, para responder ás infeccións da forma máis eficaz posible. Por outra banda, moitos patóxenos adquiriron a capacidade de manipular o metabolismo do hóspede para favorecer a súa propia propagación. É por iso que este novo enfoque pode proporcionar información moi valiosa con potenciais aplicacións para reducir o impacto das enfermidades infecciosas no ámbito da acuicultura.

Formarase o interesado en técnicas de secuenciación masiva e análise metabolómica, que son a base para identificar as rutas e metabolitos implicados na resposta inmune ou en maior ou menor resistencia ás enfermidades infecciosas, e realizaranse ensaios funcionais destinados a probar o posible efecto inmunomodulador de diferentes metabolitos, hormonas metabólicas ou compostos reguladores do metabolismo.

Tamén se fará uso da especie modelo de peixe cebra (Danio rerio) para a selección preliminar de compostos candidatos potenciais para aplicar posteriormente a especies comerciais. Realizaranse análises bioinformáticas, técnicas de bioloxía molecular (extracción de ácidos nucleicos, síntese de ADNc , PCR en tempo real...) e técnicas de microscopía, entre outras.

Requisitos: As persoas solicitantes deben estar a cursar un título de Grao ou Máster e cumprir con todos os requirimentos contemplados na convocatoria.

Grupo:  Ecoloxía e Recursos Mariños

Área: Vida  Referencia da oferta: JAEINT24_EX_1453

Contacto: Jose Pintado Valverde

Sugar kombu (Sacharina latissima) é unha especie prometedora na acuicultura europea de algas, cun gran potencial para o seu uso nun sistema integrado de acuicultura multitrófica (IMTA), asociado ao cultivo de mexillón (Mytilus galloprovincialis), que serve para captar nutrientes e mitigar o impacto ambiental.

As comunidades bacterianas asociadas ás macroalgas xogan un papel determinante na fisioloxía das algas, considerándoas a esta e a súa microbiota asociada como unha entidade funcional singular ou holobionte. Neste contexto, o coñecemento das comunidades bacterianas pode ser fundamental na acuicultura de algas para establecer condicións que eviten fenómenos de disbiose e garanticen a saúde das algas.

A formación estaría relacionada coa liña de investigación en curso, dirixida ao estudo de modelos piloto de sistemas IMTI cun enfoque ecosistémico, e centraríase no estudo do microbioma do azucre kombu nun sistema IMTI no mar, asociado a cultivos de mexillón en punt.

Estudaranse as comunidades microbianas do xermoplasma de S. latissima empregadas para a sementeira de sistemas de cultivo de longa liña , así como a súa evolución nos cultivos en diferentes épocas. Tamén se realizará un estudo comparativo con exemplares silvestres da mesma zona.

Analizarase a análise das comunidades bacterianas epífitas da alga a partir da extracción do ADN bacteriano obtido da superficie da alga, e da amplificación da rexión V4 do xene de ARNr 16S, analizada posteriormente mediante secuenciación Miseq (Illumina). Así, a estadía formativa permitirá ao aspirante/a iniciar a actividade investigadora, familiarizándose con diferentes aspectos teóricos e técnicos do cultivo de macroalgas, microbioloxía, análise molecular e bioinformática, relacionados coa liña de traballo en curso, contribuíndo á comprensión das interaccións microbianas en acuicultura de algas e as súas implicacións para os sistemas IMTA.

Requisitos: As persoas solicitantes deben estar a cursar un título de Grao ou Máster e cumprir con todos os requirimentos contemplados na convocatoria.

Grupo:  Biosistemas e Enxeñaría de Bioprocesos

Área: Vida  Referencia da oferta: JAEINT24_EX_0519

Contacto: Miriam Rodríguez García

A “microbioloxía preditiva” é unha disciplina centrada no modelado matemático de dinámicas de microorganismos de relevancia para a calidade e seguridade alimentaria. Mentres as estruturas matemáticas son coñecidas (ver por exemplo o modelo de Baranyi), a calibración destes modelos con datos experimentais presenta unha serie de dificultades que deben abordarse usando conceptos de estimación e identificación de parámetros para sistemas non lineais que vimos estudando no noso grupo desde hai anos.

Nestes meses de formación estudarase como a alta incerteza/variabilidade nos datos experimentais de crecemento e inactivación bacteriana impacta na incerteza das predicións dos modelos matemáticos. Esta análise permitirá responder ás seguintes preguntas de alta relevancia para o desenvolvemento da microbióloga preditiva: 

1. Podemos predicir o crecemento bacteriano en alimentos a partir de modelos matemáticos calibrados usando datos experimentais estándar de curvas de crecemento e inactivación suxeitos a unha alta incerteza/variabilidade?
2. Podemos definir cotas á incerteza nos experimentos para asegurar predicións útiles?
3. Cales son os mellores métodos para calibrar modelos de dinámicas bacterianas con datos suxeitos a alta variabilidade?

Podes atopar máis información sobre o noso grupo no sitio web de Bio2Eng.

Requisitos: As persoas solicitantes deben estar a cursar un título de Grao ou Máster e cumprir con todos os requirimentos contemplados na convocatoria.

Grupo: Laboratorio de Biotecnoloxía Acuática

Área: Vida  Referencia da oferta: JAEINT24_EX_1367

Contacto: David Saque Henriques

No ámbito da acuicultura, as anomalías de desenvolvemento dos peixes supoñen importantes retos na eficiencia da produción e afectan tanto á eficiencia dos animais como á eficiencia dos animais. benestar. Fundamental para abordar estes desafíos é unha comprensión profunda do desenvolvemento dos peixes. Dada a natureza dinámica do desenvolvemento, aproveitar as técnicas de aprendizaxe automática xunto co modelado dinámico é unha vía prometedora para resolver problemas críticos na acuicultura.

O peixe cebra xurdiu como un modelo vital para os estudos do desenvolvemento dos vertebrados debido á súa semellanza xenética con outros vertebrados e á súa fase embrionaria transparente. O seu uso no contexto da acuicultura é inestimable para examinar os procesos fisiolóxicos e as vías de desenvolvemento.

Este proxecto de máster centrarase en dous tipos celulares que se sabe que están asociados a anomalías do desenvolvemento en peixes de cultivo: osteocitos e cromatóforos. Os osteocitos xogan un papel crucial na formación e mantemento dos ósos, mentres que os cromatóforos son células que conteñen pigmento integrantes da cor. As aberracións no desenvolvemento destas células poden levar a deformidades esqueléticas e trastornos da pigmentación, respectivamente.

Neste proxecto, a persoa candidata utilizará un enfoque combinado de aprendizaxe automática e bioloxía de sistemas para facer enxeñaría inversa de redes de diferenciación celular a partir de datos de transcriptómica unicelular.

Os obxectivos do alumno neste proxecto serán:

1) Mediante un estudo publicado sobre o desenvolvemento embrionario, identificará células maduras e rastrexará ata os seus proxenitores coa axuda de algoritmos de análise pseudotemporal. Este procedemento descubrirá os factores fundamentais de transcrición e as vías de sinalización que impulsan a diferenciación celular.

2) A partir da información bibliográfica e dos datos de transcriptómica unicelular, o alumno construirá unha rede cualitativa inicial de regulación da diferenciación.

3) Finalmente, para aproveitar o poder da bioloxía de sistemas e da aprendizaxe automática, este proxecto empregará SELDOM, unha ferramenta de software que opera no nexo destes campos. SELDOM é experto na construción de modelos de conxuntos dinámicos que representen a complexidade das redes reguladoras de xenes. Estes modelos son fundamentais para simular as interaccións xenéticas que impulsan o proceso de diferenciación celular, ofrecendo unha mellor comprensión da bioloxía do desenvolvemento.

O proxecto ten como obxectivo mellorar a comprensión da fisioloxía dos osteocitos e cromatóforos e abrir o camiño para innovacións no seguimento de anomalías de desenvolvemento en peixes de cultivo.

Requisitos: As persoas solicitantes deben estar a cursar un título de Grao ou Máster e cumprir con todos os requirimentos contemplados na convocatoria.

Grupo: Laboratorio de Biotecnoloxía Acuática

Área: Vida  Referencia da oferta: JAEINT24_EX_0999

Contacto: María Saura Alvarez

Esta proposta responde á motivación para afondar no coñecemento da base xenética da resistencia ás enfermidades subxacentes na acuicultura, co obxectivo de incorporar de forma eficiente este carácter complexo aos esquemas de selección xenética.

A investigación actual indica que a microbiota intestinal xoga un papel fundamental na modulación do sistema inmunitario. Este proxecto busca proporcionar unha nova perspectiva ao estudo da resistencia ás enfermidades na acuicultura mediante a aplicación de enfoques metaxenómicos.

Para levar a cabo este fin, realizouse un experimento de infección coa bacteria Yersinia ruckeri, utilizando unha mostra de 200 individuos (100 controis e 100 pacientes). Ademais, os datos de expresión de ARN están dispoñibles no intestino, que se integrarán cos datos do microbioma.

Estes datos de ARN proporcionarán información adicional sobre os mecanismos moleculares subxacentes á resposta inmune dos peixes ea súa relación coa diversidade e abundancia de especies da microbiota. A análise dos perfís taxonómicos da variación e abundancia da microbiota en peixes sans e infectados, xunto cos datos de expresión de ARN, proporcionarán unha comprensión máis completa da influencia da microbiota intestinal no estado de saúde dos peixes.

Explorarase o potencial de aplicar estes coñecementos para mellorar a resposta do hóspede á enfermidade, xa sexa seleccionando individuos con perfís microbianos específicos ou administrando probióticos. Espérase que os resultados obtidos non só contribúan a optimizar os programas de mellora xenética en acuicultura, senón tamén a sentar as bases para futuras investigacións sobre a interacción entre a microbiota e os xenomas do hóspede, así como sobre os mecanismos moleculares implicados na resposta inmune. de peixes.

Este enfoque integrador promete avanzar significativamente no avance do coñecemento no ámbito da saúde e da produción en acuicultura.

Requisitos: As persoas solicitantes deben estar a cursar un título de Grao ou Máster e cumprir con todos os requirimentos contemplados na convocatoria.

Grupo: Laboratorio de Biotecnoloxía Acuática

Área: Vida  Referencia da oferta: JAEINT24_EX_1260

Contacto: Josep Rotllant Moragas

Os microARNs circulantes (C-miRNAs) son pequenas moléculas de ARN non codificantes altamente conservadas que orquestran unha ampla gama de procesos biolóxicos mediante a regulación post-transcripcional da expresión xénica.

Un aspecto interesante da identificación destas moléculas como biomarcadores provén dunha expresión temporal e espacial finamente regulada, a súa secreción das células ao medio extracelular e a súa alta estabilidade nos fluídos corporais.Todas estas características dan aos C-miRNAs o potencial de converterse nunha ferramenta valiosa e pouco invasiva para medir o benestar e a saúde dos animais. Polo tanto, existe un gran interese en estudar a importancia dos C-miRNAs como posibles biomarcadores para avaliar o benestar durante os procesos de domesticación e cultivo dunha determinada especie.

Neste traballo o noso obxectivo será mapear, caracterizar e establecer diferentes C-miRNAs en diferentes tecidos do polbo común (Octopus vulgaris) para utilizalos como biomarcadores para a avaliación do estado de saúde e benestar desta especie en poboacións naturais e no proceso da súa domesticación e produción en sistemas de cultivo intensivo.

Requisitos: As persoas solicitantes deben estar a cursar un título de Grao ou Máster e cumprir con todos os requirimentos contemplados na convocatoria.